Uma vagem (também mencionada como pod) é o receptáculo onde seres humanos sinteticamente criados são inseridos e conectados às usinas de energia, onde se tornam parte dela e, virtualmente, integram a Matrix.
Os seres humanos são cultivados nos campos de fetos onde, com base na descrição de Morpheu sobre as vagens, eles são imediatamente conectados em vários cabos e uma miríade umbilical que não só fornece o sustento alimentar ao corpo, mas envia a energia térmica do corpo para as Máquinas e sua cidade. Eles são recolhidos dos campos e transferidos para as usinas por Ceifeiras que ficam rondando os campos.
A central de controle de um ser humano que está em uma vagem é uma sonda de dados que está firme e permanentemente ligada ao headjack, que fornece a conexão da mente do ser humano com a Matrix. Cada humano em uma vagem pode ser comparado a uma estação de rádio; Um sinal portador para cada mente humana transmite e recebe dados da Fonte que, por sua vez, processa as informações necessárias para formar o mundo neural-interativo da Matrix.
Um humano preso em sua vagem.
Cada humano faz parte da rede de computadores que integram a Matrix até que seu corpo não possa mais funcionar, ou se seu sinal portador for interrompido, forçando o ser humano a despertar. Quando isso acontece, os docbots parecem receber comandos de expulsar o humano de sua vagem e despejá-lo no mundo frio e sem vida dos esgotos e restos das antigas cidades humanas, onde ele, presumivelmente, viverá os momentos mais aterrorisantes e confusos de sua breve e real vida e, inevitavelmente, acabará por morrer de fome.
Como visto no primeiro filme da trilogia, uma vez que um humano preso em uma vagem nunca usou seu corpo de forma significativa, seus músculos ficaram muito fracos a ponto de atingirem a atrofia, tornando a natação uma tarefa quase impossível de ser realizada. Crianças e adultos expulsos de suas vagens podem, no entanto, terem sido "ajudados" através da intervenção de pessoas de Zion nas proximidades, que os resgatam usando aerodeslizadores e os alimentam para se tornarem parte da resistência contra as Máquinas.
Em sua única conversa com o Arquiteto, Neo é advertido que, sem sua cooperação em recarregar a Matrix, toda a humanidade, incluindo os seres humanos conectados à Matrix, morreriam se a Matrix sofresse um colapso do sistema devido a complicações causadas por sua programação.
É visto que milhões e milhões dessas vagens estão conectadas à torres cilíndricas que formam as usinas.